Une nouvelle étude a dévoilé un rôle clé du microbiome intestinal dans l’adaptation des cervides vivant sur le plateau de Qinghai-Xizang, connu sous le nom de «toit du monde».
L’étude offre une nouvelle perspective dans les mécanismes par lesquels le microbiote intestinal aide les hôtes à s’adapter aux environnements extrêmes, selon le Northwest Institute of Plateau Biology (NWIPB), sous l’Académie chinoise des sciences.
L’étude, menée par des chercheurs de NWIPB, a été publiée dans le BMC Biology Journal.
Avec une altitude moyenne de plus de 4 000 mètres, le plateau de Qinghai-Xizang est l’un des écosystèmes d’altitude les plus élevés du monde avec l’environnement naturel le plus dur.
Ses niveaux d’oxygène extrêmement faibles, de faibles températures et d’autres conditions environnementales posent de graves défis à la survie des animaux sauvages locaux.
Le microbiote intestinal diversifié chez les animaux joue un rôle essentiel dans la formation de la physiologie de l’hôte, de l’adaptation écologique et de l’évolution.
Cependant, les mécanismes adaptatifs des grands mammifères, en particulier les cervides, aux environnements extrêmes du plateau restent largement sous-explorés et insuffisamment abordés, selon Zhang Tongzuo, chercheur au NWIPB.
Les cervides sont la deuxième famille la plus diversifiée d’ongulés uniformes, suivant la famille Bovidae. Cette famille possède une adaptabilité exceptionnelle, leur permettant de prospérer dans un large éventail d’environnements géographiques et climatiques.
L’équipe de recherche du NWIPB, spécialisée dans l’écologie animale et la conservation des ressources, a lancé une étude de séquençage métagénomique à grande échelle sur le microbiote intestinal de plusieurs espèces de cervidé vivant au plateau.
Ceux-ci ont été systématiquement comparés et analysés par rapport au microbiote intestinal des cervides ordinaires des bases de données publiques.
Les chercheurs se sont concentrés sur la découverte des rôles fonctionnels spécifiques du microbiote intestinal pour permettre l’adaptation de l’hôte, ainsi que la dynamique coévolutionnaire entre le microbiote et leurs hôtes vivant sur le plateau.
L’étude a généré un total de 41 847 génomes assemblés au métagénome et 3 193 poubelles de génome de haute qualité, établissant un catalogue complet de microbiomes intestinaux pour les cervides.
Sur la base du catalogue, les chercheurs ont construit la première carte métagénomique du tractus intestinal de plusieurs espèces de cervides de plateau.
Il s’agit de la première banque de ressources de microbiote intestinale de cervidé – à la fois au niveau national et international – basé sur une analyse métagénomique à grande espèce et à grande échelle.
Il fournit une base de données solides pour l’exploration fonctionnelle ultérieure, l’utilisation des ressources microbiennes et la protection des espèces menacées, selon Zhang.
L’étude a révélé une relation coévolutionnaire entre les cervides de plateau et leur microbiote intestinal. En outre, il a indiqué que le microbiote intestinal des cervides de plateau a subi des adaptations au niveau du génome liées au métabolisme énergétique.
« Les diverses résultats de cette étude mettent en évidence l’évolution génomique adaptative du microbiote intestinal en contribuant à l’adaptabilité du plateau des cervides, soutenant l’innovation théorique et la conservation du plateau de Qinghai-Xizang », a déclaré Zhang.
Deer sur la série Plateau
(Couverture: un cerf de Thorold est vu dans la Réserve naturelle nationale de Qilianshan, City de Zhangye, province de Gansu, nord-ouest de la Chine, 16 juillet 2024. / VCG)
